Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms