Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX12Q9UMY4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms