Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms