Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDRG4Q9ULP0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDRG4Q9ULP0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms