Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSEQ9UL01 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms