Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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