Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NOP53Q9NZM5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOP53Q9NZM5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms