Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms