Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM9Q9NXL9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms