Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.359e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 AC020915.6-202ENST00000637310 1463 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.35□□□□□ -0.271e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 ZNF544-213ENST00000599227 3587 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 ZNF544-204ENST00000595981 895 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.761e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.031e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 220.05■□□□□ 0.82e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.82■□□□□ 0.68e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.178e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.28e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.218e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRRC37B-206ENST00000578674 2807 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.228e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.298e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRRC37B-219ENST00000583758 731 ntTSL 56.87□□□□□ -1.318e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.338e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRRC37B-216ENST00000582815 582 ntTSL 55.2□□□□□ -1.588e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 ZXDC-204ENST00000515545 2635 ntTSL 1 (best)17.29■□□□□ 0.367e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.297e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 SPG7-210ENST00000564409 717 ntTSL 315.55■□□□□ 0.087e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 CHPT1-207ENST00000552213 598 ntTSL 313.66□□□□□ -0.224e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 SPG7-209ENST00000564047 422 ntTSL 213.42□□□□□ -0.267e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 CHPT1-203ENST00000546873 624 ntTSL 37.49□□□□□ -1.214e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 518.08■□□□□ 0.488e-9■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 215.37■□□□□ 0.058e-9■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 413.97□□□□□ -0.178e-9■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 48.77□□□□□ -1.018e-9■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 514.17□□□□□ -0.146e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 BCAR1-217ENST00000566465 547 ntTSL 415.96■□□□□ 0.157e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 AFMID-213ENST00000591538 487 ntTSL 317.46■□□□□ 0.394e-7■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.273e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.223e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 SLC22A18-213ENST00000498244 325 ntTSL 223.7■■□□□ 1.382e-7■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 415.93■□□□□ 0.141e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 RREB1-206ENST00000471433 1021 ntTSL 513.63□□□□□ -0.231e-9■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 513.63□□□□□ -0.231e-9■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.213e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 PAPD7-206ENST00000515721 603 ntTSL 328.66■■■□□ 2.183e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 TSSC2-202ENST00000526284 1244 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.189e-8■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 TSSC2-203ENST00000526488 674 ntTSL 312.5□□□□□ -0.419e-8■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 ZNF787-201ENST00000586787 386 ntTSL 1 (best)19.52■□□□□ 0.721e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.212e-7■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.22e-7■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC12.13□□□□□ -0.474e-7■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 TBCD-207ENST00000571796 1940 ntTSL 1 (best)19.47■□□□□ 0.713e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 TBCD-210ENST00000572953 702 ntTSL 511.85□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 TBCD-213ENST00000574422 879 ntTSL 211.74□□□□□ -0.533e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 TBCD-205ENST00000571618 775 ntTSL 310.93□□□□□ -0.663e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 TBCD-217ENST00000574975 867 ntTSL 510.87□□□□□ -0.673e-6■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 NEU4-211ENST00000435855 2281 ntTSL 223.35■■□□□ 1.334e-7■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.194e-7■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.014e-7■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 NEU4-217ENST00000618597 3013 ntTSL 220.49■□□□□ 0.874e-7■■■□□ 14.7
SLTMQ9NWH9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.987e-9■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.167e-9■■■□□ 14.6
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SLTMQ9NWH9 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-213ENST00000530953 508 ntTSL 514.68□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-208ENST00000526129 1536 ntTSL 212.29□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-217ENST00000534334 1149 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.962e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-210ENST00000526930 581 ntTSL 35.92□□□□□ -1.462e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-206ENST00000525808 1422 ntTSL 25.06□□□□□ -1.62e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-212ENST00000529059 1357 ntTSL 24.98□□□□□ -1.612e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.722e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ACADM-209ENST00000526196 1451 ntTSL 1 (best)4.02□□□□□ -1.772e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 521.17■□□□□ 0.989e-8■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.939e-8■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.429e-8■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 217.51■□□□□ 0.399e-8■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.229e-8■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.219e-8■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 217.84■□□□□ 0.457e-8■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.417e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.477e-10■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.355e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ST20-MTHFS-202ENST00000494999 632 ntTSL 322.65■■□□□ 1.227e-10■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.177e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)22.05■■□□□ 1.125e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.17e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.867e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.85e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.737e-10■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.77e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.627e-10■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RAB43-206ENST00000457077 574 ntTSL 418.8■□□□□ 0.67e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 516.28■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.137e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.087e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 514.57□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.44□□□□□ -0.11e-11■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.227e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.297e-7■■■□□ 14.6
SLTMQ9NWH9 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.37e-7■■■□□ 14.6
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