Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF275Q9NSD4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF275Q9NSD4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms