Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms