Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms