Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-204ENST00000535542 951 ntTSL 321.48■■□□□ 1.032e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-214ENST00000543023 845 ntTSL 319.96■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-202ENST00000355486 574 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-215ENST00000543562 444 ntTSL 1 (best)16.81■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-203ENST00000441922 359 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-212ENST00000467053 691 ntTSL 314.96□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 258.2
UTP3Q9NQZ2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 258
UTP3Q9NQZ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.329e-7■■■■■ 258
UTP3Q9NQZ2 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 258
UTP3Q9NQZ2 PRKAA1-206ENST00000506652 1082 ntTSL 58.93□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 258
UTP3Q9NQZ2 PRKAA1-207ENST00000509874 692 ntTSL 46.02□□□□□ -1.459e-7■■■■■ 258
UTP3Q9NQZ2 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.479e-7■■■■■ 258
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-211ENST00000493524 890 ntTSL 515.55■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 257.8
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-207ENST00000468360 757 ntTSL 513.77□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 257.8
UTP3Q9NQZ2 LEPR-206ENST00000462765 2117 ntTSL 1 (best)18.33■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 257.7
UTP3Q9NQZ2 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 257.7
UTP3Q9NQZ2 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 257.7
UTP3Q9NQZ2 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 257.6
UTP3Q9NQZ2 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-9■■■■■ 257.6
UTP3Q9NQZ2 ORAOV1-216ENST00000543863 533 ntTSL 37.98□□□□□ -1.131e-12■■■■■ 257.2
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-202ENST00000439724 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 256.9
UTP3Q9NQZ2 AC004223.3-202ENST00000591723 676 ntTSL 517.67■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 256.7
UTP3Q9NQZ2 RGL2-241ENST00000476616 1141 ntTSL 517.11■□□□□ 0.332e-17■■■■■ 256.7
UTP3Q9NQZ2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 256.7
UTP3Q9NQZ2 AC004223.3-203ENST00000592181 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.2■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 256.7
UTP3Q9NQZ2 BRAT1-206ENST00000493232 5360 ntTSL 219.42■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 256.2
UTP3Q9NQZ2 BRAT1-203ENST00000467558 4440 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 256.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A12-201ENST00000263812 2429 ntTSL 28.01□□□□□ -1.133e-11■■■■■ 256.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-11■■■■■ 256.2
UTP3Q9NQZ2 CYTH3-208ENST00000482460 557 ntTSL 324.12■■□□□ 1.454e-8■■■■■ 256.1
UTP3Q9NQZ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.653e-8■■■■■ 256
UTP3Q9NQZ2 CBARP-205ENST00000591127 933 ntTSL 522.9■■□□□ 1.263e-8■■■■■ 256
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH2-201ENST00000316594 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.394e-18■■■■■ 255.7
UTP3Q9NQZ2 AAMP-208ENST00000475678 2270 ntTSL 217.55■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 255.4
UTP3Q9NQZ2 AAMP-209ENST00000489767 1833 ntTSL 517.33■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 255.4
UTP3Q9NQZ2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 255.4
UTP3Q9NQZ2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 255.4
UTP3Q9NQZ2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 255.4
UTP3Q9NQZ2 AAMP-205ENST00000447885 671 ntTSL 514.27□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 255.4
UTP3Q9NQZ2 AAMP-206ENST00000461911 567 ntTSL 212.35□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 255.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-205ENST00000416918 473 ntTSL 311.72□□□□□ -0.531e-10■■■■■ 255.2
UTP3Q9NQZ2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 255.1
UTP3Q9NQZ2 LRCH4-210ENST00000498539 819 ntTSL 316.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 254.9
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.971e-12■■■■■ 254.8
UTP3Q9NQZ2 C11orf80-217ENST00000534325 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.89■□□□□ 0.775e-13■■■■■ 254.6
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-213ENST00000540241 608 ntTSL 313.93□□□□□ -0.188e-8■■■■■ 254.6
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.946e-7■■■■■ 254.6
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.786e-7■■■■■ 254.6
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 254.6
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 254.6
UTP3Q9NQZ2 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 254.4
UTP3Q9NQZ2 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 254.3
UTP3Q9NQZ2 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 254.3
UTP3Q9NQZ2 SLC39A11-213ENST00000582769 567 ntTSL 513.6□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 254.3
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-208ENST00000471540 3176 ntTSL 513.2□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 254.3
UTP3Q9NQZ2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 254.2
UTP3Q9NQZ2 IL17RA-203ENST00000477874 651 ntTSL 322.16■■□□□ 1.148e-12■■■■■ 254.2
UTP3Q9NQZ2 IL17RA-202ENST00000459971 621 ntTSL 219.51■□□□□ 0.718e-12■■■■■ 254.2
UTP3Q9NQZ2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.478e-12■■■■■ 254.2
UTP3Q9NQZ2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.48e-12■■■■■ 254.2
UTP3Q9NQZ2 MAP2K7-205ENST00000468058 1589 ntTSL 228.38■■■□□ 2.134e-7■■■■■ 254
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 212.17□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 253.8
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 511.59□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 253.8
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 28.14□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 253.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 253.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.163e-9■■■■■ 253.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 253.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM117-205ENST00000550495 576 ntTSL 55.68□□□□□ -1.53e-9■■■■■ 253.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM117-203ENST00000546868 2607 ntTSL 1 (best)5.08□□□□□ -1.63e-9■■■■■ 253.6
UTP3Q9NQZ2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 253.5
UTP3Q9NQZ2 EXOSC10-207ENST00000474216 2007 ntTSL 215.7■□□□□ 0.13e-17■■■■■ 253.4
UTP3Q9NQZ2 RHPN2-204ENST00000588388 2378 ntTSL 213.82□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 253.4
UTP3Q9NQZ2 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.749e-7■■■■■ 253.4
UTP3Q9NQZ2 EXOSC10-205ENST00000470611 401 ntTSL 38.47□□□□□ -1.053e-17■■■■■ 253.4
UTP3Q9NQZ2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 253.3
UTP3Q9NQZ2 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 253.3
UTP3Q9NQZ2 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.016e-8■■■■■ 253.1
UTP3Q9NQZ2 NPHP4-206ENST00000468253 781 ntTSL 221.31■■□□□ 18e-7■■■■■ 253
UTP3Q9NQZ2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 253
UTP3Q9NQZ2 MPP3-208ENST00000496503 2186 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 253
UTP3Q9NQZ2 MPP3-202ENST00000398393 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 253
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-210ENST00000582059 561 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.53e-12■■■■■ 253
UTP3Q9NQZ2 POP1-202ENST00000401707 4719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.529e-7■■■■■ 253
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-211ENST00000568586 648 ntTSL 231.17■■■□□ 2.585e-7■■■■■ 252.6
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-209ENST00000565511 783 ntTSL 325.25■■□□□ 1.635e-7■■■■■ 252.6
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 225.01■■□□□ 1.595e-7■■■■■ 252.6
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-207ENST00000563109 710 ntTSL 320.19■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 252.6
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 317.79■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 252.6
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