Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN4Q9NQC3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms