Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AKIP1Q9NQ31 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AKIP1Q9NQ31 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms