Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms