Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms