Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms