Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms