Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZY4

COA1, Cytochrome c oxidase assembly factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA1Q9GZY4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COA1Q9GZY4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COA1Q9GZY4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms