Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR88Q9GZN0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR88Q9GZN0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms