Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms