Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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