Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD2

MRPL9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL9Q9BYD2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL9Q9BYD2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL9Q9BYD2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms