Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms