Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms