Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms