Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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