Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRQ99707 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRQ99707 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRQ99707 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRQ99707 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms