Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms