Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms