Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00477Q96M19 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms