Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms