Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS4Q96HW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS4Q96HW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms