Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms