Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTP4Q96DX8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms