Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHMTQ93088 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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