Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CELF1Q92879 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CELF1Q92879 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms