Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN4Q92575 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms