Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms