Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms