Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE22Q8NFJ8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms