Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL2Q8NEU8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms