Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms