Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms