Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT2Q8IXI1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT2Q8IXI1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms