Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRCQ7RTU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms