Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms