Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC80Q76M96 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms